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De novoデザインを用いた化学構造の設計・評価と応用法

De novoデザインを用いた化学構造の設計・評価と応用法

～計算科学や機械学習、生成AIで、新しい分子構造をいかに設計するか～
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概要

本セミナーでは、化学構造の設計・評価について取り上げ、既知の構造や化合物に制約されない画期的な創薬、材料開発の手法を分かりやすく解説いたします。

開催日

  • 2024年1月17日(水) 10時30分 ～ 16時15分

プログラム

第1部 De novoデザインを用いた化学構造の設計・評価の進め方

(2024年1月17日 10:30〜14:30, 休憩 12:00〜13:00)

　コンピュータを利用した創薬の歴史は長い。この間多くの手法が提案され創薬現場で用いられてきた。標的たんぱく質の構造が分からない場合にはLigand-baseの対策が求められる。一方でタンパク質の構造が分かっている場合にはStructure-baseの手法が利用できる。こうした取り組みの中でポイントとなるいくつかの手法を取り上げて解説するとともに、現在の動きなども簡単に紹介する。

  1. 3次元構造活性相関
    1. CoMFAについて
    2. CoMFAの課題解決のための領域選択手法
    3. 分子構造重ね合わせの必要性
      • Hopfield neural networkによる分子構造重ね合わせ
      • その応用事例
  2. 分子表面上の特徴と構造活性相関
    1. Kohonen neural networkを用いた分子表面情報の可視化手法
    2. 分子表面上の正殿ポテンシャルと疎水性パラメータ
    3. Multi-way PLSの利用
  3. Structure-based Designについて
    1. 手法の紹介と応用事例
  4. 逆解析による候補分子構造の創出
  5. 深層学習を用いた創薬の取り組み
    • 質疑応答

第2部 De novoデザインの創薬への応用事例

(2024年1月17日 14:45〜16:15)

　近年、生成AIの急速な発展により、創薬においても生成AIを利用したde novoデザイン手法が注目されている。主に画像処理の分野で発展したVAEやGANだけではなく、自然言語処理の分野で発展したSeq2SeqやTransformerを活用した化学構造のde novoデザイン法も複数報告されるに至っている。
　本講座では、de novoデザインの創薬への応用事例として、 (1) 特発性肺線維症の標的分子であるDDR1に対するリード化合物のデザイン、 (2) 胃潰瘍や逆流性食道炎の標的分子であるGastric Proton Pumpに対するリード化合物のデザイン、最後に (3) がん転移の抑制を標的としたMMP-1阻害剤の最適化について紹介をする。
　本講座を通して、具体的なde novoデザインの事例を知ることで、創薬における生成AI等の活用に興味を持っていただけることを期待している。

  1. 化学構造の生成技術の概要
  2. ペプチド/タンパク質のde novoデザイン
    • オープンソースのプログラム (RFdiffusion) の紹介
    • RFdiffusionの創薬における活用法
  3. リード化合物のde novoデザイン
    • ファーマコフォアを指標とした生成AI手法 (Deep Quartet) の概要
    • DDR1阻害剤の設計
    • Gastric Proton Pump阻害剤の設計
  4. SAR-Matrixによるリード化合物の最適化
    • SAR-Matrixの概要
    • SAR-Matrixを用いたMMP-1阻害剤の最適化
    • SAR Matrixを基にした生成AI手法 (DeepSARM) の概要
    • DeepSARMの創薬における活用法
  5. SAR-Transferによるリード化合物の最適化
    • AS Alignmentの概要
    • AS Alignmentを用いたMMP-1阻害剤の最適化
    • DeepASの概要
    • DeepASの創薬における活用法
    • 質疑応答
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講師

  • 船津 公人 氏
    奈良先端科学技術大学院大学 データ駆動型サイエンス創造センター
    センター長, 特任教授
  • 吉森 篤史 氏
    株式会社 理論創薬研究所
    代表取締役
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主催

株式会社 技術情報協会
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お問い合わせ

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(主催者への直接のお問い合わせはご遠慮くださいませ。)

受講料

1名様
: 50,000円 (税別) / 55,000円 (税込)
複数名
: 45,000円 (税別) / 49,500円 (税込)

複数名同時受講割引について

  • 2名様以上でお申込みの場合、1名あたり 45,000円(税別) / 49,500円(税込) で受講いただけます。
    • 1名様でお申し込みの場合 : 1名で 50,000円(税別) / 55,000円(税込)
    • 2名様でお申し込みの場合 : 2名で 90,000円(税別) / 99,000円(税込)
    • 3名様でお申し込みの場合 : 3名で 135,000円(税別) / 148,500円(税込)
  • 同一法人内による複数名同時申込みのみ適用いたします。
  • 受講券、請求書は、代表者にご郵送いたします。
  • 他の割引は併用できません。

アカデミック割引

  • 1名様あたり 30,000円(税別) / 33,000円(税込)

日本国内に所在しており、以下に該当する方は、アカデミック割引が適用いただけます。

  • 学校教育法にて規定された国、地方公共団体、および学校法人格を有する大学、大学院、短期大学、附属病院、高等専門学校および各種学校の教員、生徒
  • 病院などの医療機関・医療関連機関に勤務する医療従事者
  • 文部科学省、経済産業省が設置した独立行政法人に勤務する研究者。理化学研究所、産業技術総合研究所など
  • 公設試験研究機関。地方公共団体に置かれる試験所、研究センター、技術センターなどの機関で、試験研究および企業支援に関する業務に従事する方
  • 支払名義が企業の場合は対象外とさせていただきます。
  • 企業に属し、大学、公的機関に派遣または出向されている方は対象外とさせていただきます。

ライブ配信セミナーについて

  • 本セミナーは「Zoom」を使ったライブ配信セミナーとなります。
  • お申し込み前に、 視聴環境 と テストミーティングへの参加手順 をご確認いただき、 テストミーティング にて動作確認をお願いいたします。
  • 開催日前に、接続先URL、ミーティングID​、パスワードを別途ご連絡いたします。
  • セミナー開催日時に、視聴サイトにログインしていただき、ご視聴ください。
  • セミナー資料は郵送にて前日までにお送りいたします。
  • 開催まで4営業日を過ぎたお申込みの場合、セミナー資料の到着が、開講日に間に合わない可能性がありますこと、ご了承下さい。
    ライブ配信の画面上でスライド資料は表示されますので、セミナー視聴には差し支えございません。
    印刷物は後日お手元に届くことになります。
  • ご自宅への書類送付を希望の方は、通信欄にご住所・宛先などをご記入ください。
  • タブレットやスマートフォンでも受講可能ですが、機能が制限される場合があります。
  • ご視聴は、お申込み者様ご自身での視聴のみに限らせていただきます。不特定多数でご覧いただくことはご遠慮下さい。
  • 講義の録音、録画などの行為や、権利者の許可なくテキスト資料、講演データの複製、転用、販売などの二次利用することを固く禁じます。
  • Zoomのグループにパスワードを設定しています。お申込者以外の参加を防ぐため、パスワードを外部に漏洩しないでください。
    万が一、部外者が侵入した場合は管理者側で部外者の退出あるいはセミナーを終了いたします。
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