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医薬品開発に使えるタンパク質の理論的デザイン法とタンパク質のフォールディング予測法

医薬品開発に使えるタンパク質の理論的デザイン法とタンパク質のフォールディング予測法

~深層学習ツールを用いたタンパク質の理論的設計~
オンライン 開催

開催日

  • 2024年11月27日(水) 13時00分 15時00分

修得知識

  • 医薬品開発に使えるタンパク質の深層学習ツール
  • 深層学習ツールではまだ困難なタンパク質デザインの進め方
  • タンパク質のフォールディング反応
  • 医薬品開発においてタンパク質のフォールディング反応を調べることの意義
  • タンパク質のフォールディング反応を予測できるツール

プログラム

 近年、RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold2などの深層学習ツールを用いたタンパク質の理論的設計が可能となりつつあり、大量の実験をベースとした従来のバイオ医薬品開発に革命を起こしつつある。本講座では、これらのツールの特徴をまとめて紹介し、創薬に向けた使い方を概説する。また、深層学習ツールではまだ困難な設計に使える物理学ベースのアプローチも紹介する。
 さらに、バイオ医薬品の開発や製造においては、タンパク質を正しい形へとフォールディングさせることや、フォールディングしやすいタンパク質を設計することも必要である。本講座では、これらを可能としうる「タンパク質のフォールディング予測法」についても紹介する。

  • タンパク質
  • 医薬品開発
  • 抗体
  • 中分子
  • ペプチド
  • 酵素
  • ジスルフィド結合
  • 酵素活性
  • 理論的デザイン
  • 深層学習ツール
  • 物理学ベースのツール
  • タンパク質のフォールディング
  • フォールディング中間体
  • タンパク質の凝集
  • タンパク質の可溶性
  • AlphaFold2
  • AlphaFold3
  • RoseTTAFold
  • RoseTTAFold All-Atom
  • RFdiffusion
  • RFdiffusion All-Atom
  • ProteinMPNN
  • LigandMPNN
  • Rosetta
  • AMBER
  • Gromacs
  • AGADIR
  • WSME-Lモデル
  • 質疑応答

講師

  • 新井 宗仁
    東京大学 大学院 総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系
    教授

主催

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